简介：
上古之时，大蜘蛛怪肆虐日本京城，危害人间。普通的居民们全无抵抗之力，此时出现了一位阴阳师，大蜘蛛怪被阴阳师所击败，从它被劈开的肚子里，流出大量的骷髅和小蜘蛛的尸体，其中有一只长得象小女孩一样的小蜘蛛还活着（即本作女主角蜘蛛娘），阴阳师本想斩草除根，但却下不了手，不顾旁人的劝阻，把她带回家了。阴阳师把幼小的蜘蛛娘当成人来抚养，但是半年后，附近村庄的男丁接连失踪。
边见瑞纪的爷爷拥有一家古书店并且将它出租给了学者砚周。一日，瑞纪偶然打开了一本名叫《蜘蛛怪异闻》的古书，蜘蛛娘从中掉了出来。蜘蛛娘告诉瑞纪自己曾被一个阴阳师所救抚养长大，后又被封印在书中，而砚周就是那位阴阳师的转世。砚周很同情蜘蛛娘的遭遇，收留了她。但一名古籍师告诉砚周，蜘蛛娘是非常危险的生物，只要接近她就会在不知不觉中被迷惑从而丧生。
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